灰指甲经过有效的后，一般不会反复。 但应预防再度感染，趾甲癣的再度感染率较指甲癣的高，促使再度感染的因素大致有以下几个方面：
再感染：灰指甲，但没有同时手足癣，导致指（趾）甲再度被感染，是造成甲癣反复的重要因素。
巩固：有的患者，在指（趾）甲快有效恢复正常形态时，即以为有效，便停止了用药，没有巩固用药一段时间，也会产生重新感染。
甲营养不良：因患有其他疾病等原因，引起甲营养不良，使甲板自身防御真菌的能力下降，而使指（趾）甲重新感染。
外伤：再次外伤引起致病真菌侵入甲板重新感染，这种情况不少。
化学物质刺激：长期接触汽油、油漆、洗涤剂和强碱性肥皂等物质，改变了正常皮肤甲板表面的酸碱度和防御能力，而导致重新感染。